三立副台長黃曉玫表示，《上船了各位！》早在2022年11月就開始規劃，起初是由擅長紀錄片的總導演王威翔發想，經由製作人張玉川的整合後才找到她洽談後續合作，當時她只對2人提出敲定參與藝人的要求，沒想到僅2個月的時間，7位主持人胡宇威、郭泓志、蔡昌憲、KID、瑞瑪席丹、鍾瑶、雷艾美都對題材深深著迷，很快的決定出演，「因為藝人的紛紛答應，讓我們3個人信心大增，我們原本也擔心會不會是我們一廂情願，沒想到越來越多人『上船了』。」

因為藝人們的支持，黃曉玫四處尋找資金，最後推動三立、華視、日本極東電視台、文化部等各方合作，順利促成拍攝。至於挑選石垣島的原因，黃曉玫說，雖然獨木舟運動在台灣不盛行，但在過去，蘭嶼多數原住民都靠著獨木舟生活，也曾划行到石垣島，因此他們決定效法古人精神，將目標定位在石垣島。

從初期的規劃到藝人們點頭答應，《上船了》看似一切順利，但所有「現實」問題也一一浮現。黃曉玫超過半年時間洽談資金，直到去年7月資金才真正到位，11月正式開始前置作業，隨之而來又要面對費用規劃及伴走船（母船）、引導遊艇、獨木舟的租借、承擔器材耗損風險等問題，「我們找母船找的很傷心，因為6月是遊艇旺季，我們一直被拒絕，光找船找到差點放棄；租借獨木舟也是難題，那是玩家們的寶貝，但一艘要價20幾萬，我們也不可能真的去買。」

節目在4月開拍，曾特別前往台中租借要價不凡的造浪池讓藝人們練習，黃曉玫說：「我們拍攝半天，但光放水就要兩周，成本費用7、80萬，很多時候我們都一度想放棄。」另外，加總起來破百萬的油費也讓洪曉玫直呼真的很貴。

除了費用，被黃曉玫視為最致命的，是出航時間點必須在端午節後一周，這也代表所有藝人必須在短時間內學會划行技巧及有充足的體力，她說：「我們因為節目，海象比看氣象還多，黑潮是有季節性的，端午後的黑潮是浪、風最穩定的時候，畢竟獨木舟禁不起1米5以上的海浪。」